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高保真平端PCR克隆试剂盒

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品牌: toscience
商品型号: MCK001
产品规格: MCK001
单价: 面议
起订: 1
供货总量: 1111
发货期限: 自买家付款之日起 3 天内发货
所在地: 江苏 苏州市
有效期至: 长期有效
最后更新: 2017-04-03 01:03
浏览次数: 531
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公司基本资料信息






 
 
产品详细说明
 

高保真酶产生平端PCR产物,pEcoRV Vector是一种高效克隆保真酶PCR产物(平端产物)的专用载体。本载体在E.coli自杀基因ccdB(Control of cell death)的上游启动子内引入一个EcoRV位点。自连产物转化E.coli后,ccdB基因则会表达,ccdB基因的表达蛋白,会破坏细菌的DNA gyrase,造成细菌染色体的降解导致细菌死亡(阴性克隆);载体插入外部片段的时候,破坏了ccdB的读码框,使载体能在E.coli中扩增(阳性克隆)。这样可以极大改善平端连接高背景的缺点,节省筛选的时间。

用途

  • 高保真酶的PCR产物克隆
  • 用于高保真酶PCR产物的测序(M13 primer)
  • 普通平端PCR产物克隆

储存条件

冰袋运输;长期保存-20℃(12个月以上);10 T4 DNA ligase Buffer 中含 ATP,为避免ATP的降解,建议解冻后的10 T4 DNA Ligase Buffer 分装成小包装并在-20℃保存。

产品特点

  • pEcoRV自连产物转化大肠杆菌,大肠杆菌菌落<5个/10平板。
  • pEcoRV载体和Control insert连接转化大肠杆菌,大肠杆菌菌落>100个/平板。

试剂盒组成

T4 DNA Ligase 10 T4 DNA Ligase Buffer pEcoRV vector Control insert
10U/µL 400 mM Tris-HCl,pH 7.6
100 mM MgCl2 ,100 mM DTT
5 mM ATP
20ng/µl 20ng/µl

使用示例

  1. 以 10μl 连接体系示例,在微量离心管中加入以下各种成分:
    试剂 使用量
    pEcoRV Vector(20ng/µl) 10ng
    Insert DNA 3:1 to 10:1 (molar ratio over vector)
    10 T4 DNA Ligase Buffer 1µl
    T4 DNA Ligase(10U/µL) 1µl
    ddH2O Up to 10µl
  2. 16℃反应30min;
    • 室温(25℃)也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低
    • 保温5min也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低
    • PCR产物(2Kb以上)进行DNA克隆时,连接反应时间请延长至数小时
  3. 连接产物(10ul)加入100ul DH5a(或者Top10)感受态细胞中,冰中放置30min;
  4. 42℃加热45秒后,再在冰中放置2min;
  5. 加入500ul LB培养基,37℃培养30min;
  6. 在含有Kan+的LB琼脂平板培养基上培养,37℃过夜,形成单菌落,计数;
  7. 挑选菌落,用PCR方法确认插入片段的长度。

克隆结果示例

Control Insert 连接/转化效率(cfu/ug Vector) 阳性菌落比率 效率(%)*
1 5.0 x 107 98.5 98以上
2 5.0 x 107 97.0 95以上
* 效率值菌落中的目的DNA insert片段的连入效率。

注意事项

  • 连接酶:
    • T4 DNA连接酶要求Mg2+,因此螯合Mg2+的EDTA的存在会阻碍反应;
    • NaCl或KCl浓度大于200mM时强烈抑制T4 DNA Ligase;
    • 65℃孵育10分钟或70℃孵育5分钟可以导致T4 DNA Ligase失活;
    • 聚乙二醇(PEG) 极大地增加平末端连接效率。
  • 插入片段:
    • 如果Insert DNA 太小(<100bp),不能够完全破坏ccdB的启动子,将造成筛选失败;
    • Insert DNA应该是KOD酶(货号K003)扩增(而非Taq酶)胶回收纯化处理后才进行载体连接,尽量避免其他杂带的存在;
    • PCR产物(2Kb以上)进行DNA克隆时,连接反应时间请延长至数小时。
  • 感受态细胞的选择:
    • 转化时请使用高效的热转化感受态细胞(转化效率≥1X108cfu/µg pUC19),这样才可能得到比较理想的阳性克隆。
  • 克隆产品测序引物:M13 reverse primer, M13(-40) forward primer (见下图) pEcoRV Vector 载体结构图: 

包装规格

货号 规格 包装规格
T4 DNA Ligase(10U/µL) 10 buffer pEcoRV Vector(20ng/µl) Control insert(20 ng/µl)
MCK001-20 20T 40 µl 200 µl 25µL 20µL
MCK001-100 100T 200 µl 1 ml 125µL 100µL

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