高保真酶产生平端PCR产物,pEcoRV Vector是一种高效克隆保真酶PCR产物(平端产物)的专用载体。本载体在E.coli自杀基因ccdB(Control of cell death)的上游启动子内引入一个EcoRV位点。自连产物转化E.coli后,ccdB基因则会表达,ccdB基因的表达蛋白,会破坏细菌的DNA gyrase,造成细菌染色体的降解导致细菌死亡(阴性克隆);载体插入外部片段的时候,破坏了ccdB的读码框,使载体能在E.coli中扩增(阳性克隆)。这样可以极大改善平端连接高背景的缺点,节省筛选的时间。
用途
- 高保真酶的PCR产物克隆
- 用于高保真酶PCR产物的测序(M13 primer)
- 普通平端PCR产物克隆
储存条件
冰袋运输;长期保存-20℃(12个月以上);10 T4 DNA ligase Buffer 中含 ATP,为避免ATP的降解,建议解冻后的10 T4 DNA Ligase Buffer 分装成小包装并在-20℃保存。
产品特点
- pEcoRV自连产物转化大肠杆菌,大肠杆菌菌落<5个/10平板。
- pEcoRV载体和Control insert连接转化大肠杆菌,大肠杆菌菌落>100个/平板。
试剂盒组成
T4 DNA Ligase | 10 T4 DNA Ligase Buffer | pEcoRV vector | Control insert |
---|---|---|---|
10U/µL | 400 mM Tris-HCl,pH 7.6 100 mM MgCl2 ,100 mM DTT 5 mM ATP | 20ng/µl | 20ng/µl |
使用示例
- 以 10μl 连接体系示例,在微量离心管中加入以下各种成分:
试剂 使用量 pEcoRV Vector(20ng/µl) 10ng Insert DNA 3:1 to 10:1 (molar ratio over vector) 10 T4 DNA Ligase Buffer 1µl T4 DNA Ligase(10U/µL) 1µl ddH2O Up to 10µl - 16℃反应30min;
- 室温(25℃)也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低
- 保温5min也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低
- PCR产物(2Kb以上)进行DNA克隆时,连接反应时间请延长至数小时
- 连接产物(10ul)加入100ul DH5a(或者Top10)感受态细胞中,冰中放置30min;
- 42℃加热45秒后,再在冰中放置2min;
- 加入500ul LB培养基,37℃培养30min;
- 在含有Kan+的LB琼脂平板培养基上培养,37℃过夜,形成单菌落,计数;
- 挑选菌落,用PCR方法确认插入片段的长度。
克隆结果示例
Control Insert | 连接/转化效率(cfu/ug Vector) | 阳性菌落比率 | 效率(%)* |
---|---|---|---|
1 | 5.0 x 107 | 98.5 | 98以上 |
2 | 5.0 x 107 | 97.0 | 95以上 |
注意事项
- 连接酶:
- T4 DNA连接酶要求Mg2+,因此螯合Mg2+的EDTA的存在会阻碍反应;
- NaCl或KCl浓度大于200mM时强烈抑制T4 DNA Ligase;
- 65℃孵育10分钟或70℃孵育5分钟可以导致T4 DNA Ligase失活;
- 聚乙二醇(PEG) 极大地增加平末端连接效率。
- 插入片段:
- 如果Insert DNA 太小(<100bp),不能够完全破坏ccdB的启动子,将造成筛选失败;
- Insert DNA应该是KOD酶(货号K003)扩增(而非Taq酶)胶回收纯化处理后才进行载体连接,尽量避免其他杂带的存在;
- PCR产物(2Kb以上)进行DNA克隆时,连接反应时间请延长至数小时。
- 感受态细胞的选择:
- 转化时请使用高效的热转化感受态细胞(转化效率≥1X108cfu/µg pUC19),这样才可能得到比较理想的阳性克隆。
- 克隆产品测序引物:M13 reverse primer, M13(-40) forward primer (见下图) pEcoRV Vector 载体结构图:
包装规格
货号 | 规格 | 包装规格 | |||
---|---|---|---|---|---|
T4 DNA Ligase(10U/µL) | 10 buffer | pEcoRV Vector(20ng/µl) | Control insert(20 ng/µl) | ||
MCK001-20 | 20T | 40 µl | 200 µl | 25µL | 20µL |
MCK001-100 | 100T | 200 µl | 1 ml | 125µL | 100µL |
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