壳聚糖酶在工业上可用于壳寡聚糖(Chitooligosaccharides,简称COSs)的制备,由于COSs较好的水溶性,更利于人体吸收,因而COSs在食品工业中上可作为添加剂;COSs在医药、诊断试剂等方面有着非常诱人的前景,特别是聚合度在5、6的COSs更是具有较强的抗感染、抑制肿瘤的活性;COSs具有抗菌作用,能对植物病原菌产生拮抗作用,诱导植物产生抗菌物质。但是利用化学合成方法生产COSs(尤其是具有较强生理活性的壳五糖和六糖)非常困难,产率低、生产成本较高且易污染环境,而使用专一性的壳聚糖酶通过降解生产COSs却有着高效、环保等有点,因此利用壳聚糖酶生产COSs已经成为目前研究应用的热点。壳聚糖酶是一种RP蛋白,可以提高植物的抗病能力。同时利用壳聚糖酶降解一些真菌细胞壁,用以鉴定细胞壁的精细结构,可以更有效的防治病原菌,提高农作物产量。因此壳聚糖酶可以作为农业应用中的生物控制剂。
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