近日，中国农业科学院作物科学研究所水稻优异种质资源发掘与创新利用创新团队、作物种质资源安全保存与信息化创新团队、作物生物信息与应用创新团队联合，首次系统揭示了中国主要稻区水稻品种的形成特征，相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
我国每年水稻种植面积超过4亿亩，覆盖了从热带到寒温带的各类气候区，形成了各具特色的水稻种植区。系统解析各稻区表型、基因型选择特征，挖掘优异种质基因及其组合，对加速我国水稻精准设计育种具有重要意义。
科研团队对我国五大主要稻区的6044份现代水稻品种进行深度全基因组重测序，结合五大稻区19个鉴定点212组表型数据，系统阐明了不同稻区水稻品种基因组和表型选择特征，多维度揭示了不同稻区品种适应性以及人文选择影响。根据以上数据，鉴定到3131个与抽穗期、产量以及逆境响应等关键农艺性状显著相关的位点，并克隆到水稻粒形调控新基因OsGL3.6。进一步结合已发表数据，完成了近万份水稻资源、品种的高密度变异图谱的构建，并开发出在线育种辅助工具，打造了全球最大的水稻资源育种综合数据平台——RiceAtlas，科研人员利用该平台快速改良“绥粳4号”水稻粒形。该项研究为水稻精准设计育种的智能决策提供了重要理论依据和数据支撑。
该研究得到国家自然科学基金、中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
原文链接：
https://doi.org/10.1016/j.molp.2025.03.007
