7月13日,经作所油菜遗传育种团队联合伊犁哈萨克自治州农业科学研究所、中国农业科学院油料作物研究所在国际期刊《Journal of Agricultural and Food Chemistry》(一区Top,5年IF = 6.0)在线发表了题为“Genome-Wide Association Study Reveals the Genetic Basis of Crude Fiber Components in Brassica napusL. Shoots at Stem Elongation Stage”的研究论文,油料所博士研究生史睿和伊犁农科所曹禹副研究员为论文的共同第一作者,经作所张洁夫研究员和王晓东研究员为论文的共同通讯作者。江苏农科院经作所为第一通讯单位。
甘蓝型油菜薹富含花青素、维生素C及硒、钙、锌等矿物质元素,风味独特,是一种新型的绿色蔬菜。目前对油菜薹品质研究较少,市面上的油菜薹普遍存在叶大、薹茎粗纤维(Crude fiber)含量较高等缺点,影响了其口感。本研究对包含202份变异丰富材料的关联分析群体(GWAS)进行重测序,测序深度为20×,分别鉴定出6093649个SNPs和996252个Indels。基于在四个环境中获得的表型数据,对五个粗纤维相关性状进行GWAS分析,包括中性洗涤纤维(NDF)、酸性洗涤纤维(ADF)、酸性洗涤木质素(ADL)、半纤维素(Hem)和纤维素(Cel)。在阈值-log10 (P) = 5.61 的条件下,五个粗纤维相关性状在四个环境中共检测到1285个显著SNP位点,合并后得到97个显著关联区域。此外,本研究还鉴定了7个候选基因,获得了10个粗纤维素含量低、综合性状优良的种质资源。本研究结果为解析粗纤维素性状的遗传基础提供了新的思路,为油菜薹的品质改良提供了优异的种质资源。
本研究受国家自然科学基金(32172065)和国家现代农业产业技术体系(CARS-12)等项目的支持。
文章链接:https://doi.org/10.1021/acs.jafc.4c03032