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华中农业大学动物遗传育种团队在猪调控元件鉴定方面取得新进展

放大字体  缩小字体 发布日期:2021-04-15  来源:华中农业大学
核心提示:近日,华中农业大学赵书红教授与李新云教授团队绘制了目前涵盖品种信息和组织类型最广的猪基因组启动子、增强子、开放染色质区域及三维基因组精细图谱,大规模鉴定了顺式调控元件及调控区突变位点,揭示了影响猪表型变异的潜在调控机理,为应用功能SNP位点提升猪基因组育种效率奠定了基础,相关研究成果发表在国际期刊Nature Communications 上。
  不同猪种基因组顺式调控元件和三维染色质结构
 
  调控元件及功能突变挖掘是创新猪基因组育种技术的基础
 
  由于猪基因组调控元件与功能区突变挖掘滞后,导致猪基因组的功能位点与分子标记无法区分,基因组育种芯片设计时无法充分利用功能区域和功能位点信息,影响了基因组育种效率的提升。该研究通过整合调控元件、三维基因组及全基因组关联分析(GWAS)信息,解析了猪重要性状GWAS位点在调控元件周围的分布特征,对部分重要性状候选因果突变进行了鉴定,同时通过整合不同品种间基因组突变、表观修饰、三维基因组及基因表达变异,鉴定了一批具有潜在调控功能的重要SNP。以上成果为基因组育种技术创新及效率提升提供了丰富的数据信息,为加速猪经济性状遗传改良开辟了新路径。
 
  GWAS位点在猪基因组增强子附近的分布
 
  原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-021-22448-x
 
 
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