7月12日,西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室研究人员在《基因组生物学》上发表研究论文,揭示出六倍体小麦遗传多样性来源于频繁地与野生小麦的种内杂交以及与更远缘野草的种间杂交。
作为国际小麦基因组测序联盟成员,西北农林科技大学研究人员于2016年底率先获得了内部共享、尚未发表的六倍体小麦参考基因组信息,对来自全世界的93个野生小麦、六倍体农家种和主栽品种开展全基因组重测序。面对高重复的多倍体基因组分析难题,他们通过开发新的分析流程,建立了全面的小麦变异组信息,揭示了全球最广泛种植的作物——六倍体小麦各亚基因组的遗传变异、群体内和群体间的遗传分化程度、驯化和改良阶段的受选择信号等全方位的变异系谱和变异来源。
这一首个大规模全基因组重测序研究,提供了目前数量最多、覆盖最全的六倍体小麦及其野生祖先的基因组变异集合,筛选出来自多个野生小麦群体和远源物种的大量基因渗入,其中一些渗入片段在群体中的出现频率随着驯化或改良显著增加。频率改变并与已知数量性状连锁区域的重叠,提示这些片段在驯化和改良过程中可能扮演重要角色。
该研究将为了解小麦起源、进化和驯化历史,克服小麦遗传资源同质化,促进小麦遗传改良提供重要的数据资源。
相关论文信息:http://doi.org/10.1186/s13059-019-1744-x