欧盟相关法规要求，如果食品中包含0.9%以上的基因编辑成分，需要在外包装上显示转基因-GM标记。
但是利用转基因亚麻油料作物荠蓝在田间生产欧米伽-3鱼油的先驱-洛桑研究所教授Johnathan Napier表示，通过基因编辑技术实现的性状改变很难被识别。
“通过基因编辑导致的突变与经典作物育种技术甚至自然变异出现的突变几乎相同，我不知道如何区分这几种育种方式。如果其他国家和贸易伙伴开始商业化种植基因编辑的粮食作物，然后出口至欧洲，这部分食品将很难被识别，这是欧盟监管机构迫切需要解决的问题。”
与转基因作物不同，基因编辑作物不会导入外源基因片段。尽管如此，7月欧洲法院裁定将基因编辑作物与转基因作物一视同仁。
根据Napier教授的说法，欧盟的裁决不仅违背现有的科学证据，而且最终会影响联合国制定解决贫困问题的目标。他还表示，此举将严重影响欧盟作物科学领域创新，我们强烈敦促科学界继续在欧盟开展基因编辑和转基因作物的田间试验研究，我们必须不断推进我们对作物科学和作物生物学的理解，基因编辑和转基因作物的田间试验都是该过程中的重要组成部分。“
