微藻常被称为是超级食物或未来食物。微藻中含有丰富的碳水化合物、蛋白质、脂肪酸、维生素和矿物质。如螺旋藻和小球藻中蛋白质含量可达细胞干重的50~70%。微藻多糖在食品保健品领域的免疫调节作用，具体表现在对于机体巨噬细胞免疫应答的机制调控，提高机体的免疫调节能力，提高抗肿瘤、抗病毒、抗炎、抗疲劳、抗衰老活性、保护细胞和促进伤口愈合等。微藻多糖在食品领域除了运用到保健品行业，同时也被运用到食品安全、食品涂膜保鲜、食品添加剂等行业。微藻中含有丰富的必需脂肪酸，利用微藻可生产高不饱和脂肪酸（PUFA），这种脂肪酸既无腥臭味，也不含有胆固醇。螺旋藻中的脂肪酸主要是PUFA-亚油酸和γ-亚麻酸。小球藻中富含以二十碳五烯酸（EPA）和十二碳六烯酸（DHA）为代表的ω-3高度不饱和脂肪酸，培养小球藻可直接生产EPA和DHA。但是目前只有 DHA 藻油可以作为新资源食品，其他的微藻尚未获得食品资质认可，因此多停留在研发阶段或饲料应用阶段，通过将富含 DHA 或 EPA 的微藻饲喂畜禽，从而提高肉类、蛋类或奶制品中 DHA 和 EPA 的含量，间接地将微藻中多不饱和脂肪酸用于食品行业。
我国虽然很早就有食用微藻的历史，但是近十几年才逐步获得食品资质批准。在2004 年第 17 号文件批准的食品里，钝顶螺旋藻和极大螺旋藻被正式批准可作为普通食品食用，这是我国第 1 个正式获得食品资质的微藻原料，开启了我国微藻食品原料的先河。之后随着对微藻研究的深入，更多的微藻获得新资源食品的认可，继螺旋藻之后，在 2009 年盐藻及提取物被批准为新资源食品，成为第 2 个获得食品资质的微藻。随着市场对 DHA的需求，2010 年批准 DHA 藻油和雨生红球藻可以作为新资源食品，微藻在食品领域的应用越来越广，2012、2013 年相继批准了蛋白核小球藻和裸藻作为新资源食品 。截至目前共有 5 株微藻获得食品资质，随着微藻应用价值的不断开发，微藻在食品领域逐步被认可，越来越多的企业开始从事微藻生产。
当前，市面已经可以见到越来越多的微藻产品，如以螺旋藻主打的系列增强免疫力的保健品、以杜氏盐藻主打的视力保护系列产品，也有以小球藻为主的系列食品、以雨生红球藻开发的化妆品等等。
