一、功能的不确定性
胶原蛋白是人体皮肤的主要成分，占皮肤干重的70%以上，起到皮肤支撑和锁水的作用。临床研究也指出，皮肤的紧致程度与皮肤所含胶原蛋白的量成正比，因此补充胶原蛋白被认为可以缓解皮肤衰老，起到美容的作用。凡事都有两面性，胶原蛋白也不例外。有专家指出，胶原蛋白在人体内最终会被代谢为氨基酸，并不会直接到达脸部等需要补充的地方，并且氨基酸重组的方向并不具有定向性，因此不赞同胶原蛋白美容的说法。
人体代谢系统非常复杂，蛋白质在代谢为氨基酸过程中的部分短链肽会被直接吸收，因此胶原蛋白肽的概念被提及，通过小分子肽易吸收的特点来达到美容的功效，这也是目前市面胶原蛋白的主要营销方向，鱼胶原蛋白因其低抗原性、低过敏性而成为市场的绝对主力。
二、政策较为模糊
胶原蛋白市场的快速增长，拉动了企业进驻的积极性。很多企业不敢轻易进入不在于技术壁垒，而在于政策的不确定性。首先是胶原蛋白的分类归属问题，胶原蛋白没有相应的产品标准，企业使用的基本依据是卫计委2013年7号公告:以可食用的动物或植物蛋白质为原料，经《食品添加剂使用标准》（GB2760-2011）（目前已是GB2760-2014）规定允许使用的食品用酶制剂酶解制成的物质可以作为普通食品，目前生产胶原蛋白的企业也基本都基于此条公告。
胶原蛋白相关的标准有《SB/T 10634-2011 淡水鱼胶原蛋白肽粉》《QB 2732-2005 水解胶原蛋白》《GB/T 22729-2008 海洋鱼低聚肽粉》，胶原蛋白始终没有一个准确的定位，随着2018年6月最新标准《GB 31645-2018 食品安全国家标准 胶原蛋白肽》的发布，关于胶原蛋白的归属问题可以尘埃落定。胶原蛋白肽是以富含胶原蛋白的新鲜动物组织（包括皮、骨、筋、腱、鳞等）为原料，经提取、水解、精致生产的，相对分子量低于10000的产品。
Lumi、汤臣倍健、Swisee等胶原蛋白销售主力品牌都采用分子量较低的胶原蛋白 粉作为主料，GB 31645-2018的发布坚定了胶原蛋白的市场意义，对有意进入胶原蛋白行业的企业起到了积极的推动作用，也增加了行业快速发展的可行性，以胶原蛋白为基础的产品将迎来新一轮"爆发"。
