RNA操作是目前研究的热点之一。要实现精确的RNA操作,需要特异地识别靶向目标RNA分子并对其进行剪切。但到目前为止,这类序列特异的RNA内切酶在自然界中还没有被发现。因此,寻找一类序列特异的RNA内切酶显得尤为重要。中科院植物研究所卢从明研究组日前在相关领域取得进展,相关论文2月6日在线发表于美国《国家科学院院刊》。
卢从明研究组通过一系列生化实验发现,PPR-SMR蛋白家族成员SOT1能够在体外特异且高效地剪切其RNA底物。通过生化、分子与遗传等分析,研究人员进一步发现SOT1的PPR结构域能够特异识别叶绿体23S-4.5S核糖体RNA前体末端一段含有13个核苷酸的序列,并剪切了该识别序列的下游序列,从而参与了拟南芥叶绿体23S-4.5S核糖体RNA前体的成熟。研究人员还通过突变SOT1蛋白的PPR结构域的特定位点,使突变的蛋白能够识别并剪切预期的RNA底物而不再识别并剪切原来的RNA底物。
这一结果首次证明SOT1具有序列特异的RNA内切酶活性,且能够被人工改造用来识别并剪切预期的RNA底物,可以作为一种RNA操作工具而具有广泛的应用前景。