一般来说，到了晚上，人眼的瞳孔通常会大过6毫米。所以，长期戴这类彩色隐形眼镜，夜间的视力范围和清晰度会受到影响。
角膜水肿和角膜机械性损伤：彩色隐形眼镜阻碍了角膜从空气中得到氧气，角膜缺氧造成角膜上皮细胞水肿且易剥落，使得配戴或取下镜片时易造成角膜上皮机械性的损伤。特别是戴镜初期，主要表现为眼睛发红、怕光、流泪、异物感、看东西模糊。
巨乳突状结膜炎：因为镜片与结膜接触，睁闭眼时反复摩擦刺激，或是对镜片本身或消毒药水的过敏反应引起。主要表现是眼睑结膜（眼皮的内面）可见红石榴子一样的突起。初期不易被发觉，严重时表现为眼睛发红、发痒、分泌物多，戴镜后便出现镜片移位、视力模糊、异物感等。
角膜炎和角膜溃疡：角膜一旦被破坏可导致角膜感染甚至角膜溃疡穿孔。病原菌可以是来自于被污染的隐形眼镜镜片或护理液，也可以原本就存在于病人的眼表组织里。主要表现为眼睛发红、怕光、流泪、异物感、看东西模糊，溃疡明显者可以看见黑眼球上白色斑点，表面凹陷，并有分泌物。
角膜白斑和角膜血管增生：角膜溃疡不易治疗，如有幸能够控制也会形成角膜白斑影响视力，有时需角膜移植才能挽回。在长期缺氧的情况下，血管便由角膜边缘向中央生长以向角膜提供氧分，但却可引致角膜混浊，甚至失明。
彩色物质泄出而损伤眼睛：由于彩色隐形眼镜的色彩是渗进镜片的，如果生产技术不过关，日后还可能有彩色物质泄出而损伤眼睛的危险。
