HPLC的色谱柱(分离柱)是极其重要的部件之一，一般可分为反相柱、正相柱、其他柱三类。
①反相色谱柱：它是使用最多的一种色谱柱；一般约占70％；其中，C18柱约占65％；C8柱占15％左右；苯基柱＜5％。反相色谱是目前应用得最为广泛的一种高效液相色谱方法。C18在反相色谱中应用得最为广泛。大概超过一半。
②正相色谱柱：正相色谱柱也经常被使用，它约占20％。
③其他色谱柱(手性柱、离子交换柱)：约占10％。
要用好、保护好色谱柱，是一个需要特别重视的问题，如果稍有不慎，就有可能降低色谱柱的柱效、缩短色谱柱的寿命，甚至损坏色谱柱，下面介绍用好色谱柱的关键。
用好色谱柱的关键。
①经常冲洗色谱柱。每次使用后，必须用强溶剂冲洗30分钟左右，或者冲洗床体积(柱体积)的20倍左右。
②色谱柱较长时间不使用时，应该对色谱柱充满甲醇或乙腈，最后浸泡在甲醇中；作者一般是将长期不用的色谱柱浸泡在甲醇中，效果很好。
③柱头必须拧紧，不许有任何缓冲液留在色谱柱内。
④在改变溶剂的组成时，有机溶剂和水之间的切换应该缓慢进行，如果快速变换，有可能损坏色谱柱。
⑤对于复杂体系的样品(如生物样品、中药样品)一定要进行预处理，或者在色谱柱和进样器之间加入保护柱。
⑥不能对一般色谱柱进行反冲洗，否则将迅速降低色谱柱效；但是，色谱柱的生产者指明该色谱柱可以反冲洗时例外。
⑦色谱柱不能受到强烈的机械振动；不能在压力和温度急剧变化的情况下使用，否则色谱柱内的填料会受到影晌。
