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枸杞木糖异构酶基因LbxylA的克隆、原核表达及多克隆抗体的制备

放大字体  缩小字体 发布日期:2019-07-04
核心提示:木糖异构酶(EC?5.3.1.5)在生物体内的糖代谢过程中发挥着重要的作用,主要参与醛糖对酮糖的转化,尤其是木糖对木糖的转化;也参与D-葡萄糖转化为D-果糖的异构化反应。木糖异构酶与蛋白酶、淀粉酶等同为重要的工业用酶,具有极其重要的价值。
   木糖异构酶(EC?5.3.1.5)在生物体内的糖代谢过程中发挥着重要的作用,主要参与醛糖对酮糖的转化,尤其是木糖对木糖的转化;也参与D-葡萄糖转化为D-果糖的异构化反应。木糖异构酶与蛋白酶、淀粉酶等同为重要的工业用酶,具有极其重要的价值。在细菌和一些厌氧型真菌中,木糖异构酶能直接将木糖转化为木酮糖,不产生副产物,有利于乙醇的生产。近年来,随着生物能源产业的发展,利用木糖异构酶构建发酵半纤维素水解产物木糖生产乙醇的重组菌成为研究热点。
 
  来自宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所,国家枸杞工程技术研究中心的赵建华、尹 跃和宁夏农林科学院荒漠化治理研究所的李浩霞等人以‘宁杞1号’枸杞果实为材料,基于枸杞果实转录组测序数据,从枸杞果实中克隆LbxylA的cDNA全长,诱导重组质粒pGEX4T-1-LbxylA在大肠杆菌中表达,并对得到LbxylA融合蛋白进行多克隆抗体制备,有助阐明该基因在果实糖积累过程中作用机理,为进一步改善枸杞果实品质及转基因植株标记选取提供理论依据。
 
  1、LbxylA克隆分析
 
  基于枸杞转录组差异表达数据比对分析,发现TR29089|c0_g1的EST基因在枸杞果实发育过程中FPKM值呈现出显着差异。以该EST序列设计特异性引物,并从枸杞果实的mRNA反转录产物中获得LbxylA基因片段,测序结果为1446?bp,含有一个1446?bp的ORF,编码有348 个氨基酸,其理论等电点和分子质量分别为5.37?kDa和53.54?kDa,该基因的氨基酸序列分子式为C2405H3692N644O709S18。
 
  2、LbxylA所编码氨基酸序列及进化树分析
 
  进一步使用NCBI Conserved Domains(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi)对其结构域进行分析,发现该基因Asn17~Leu481位氨基酸序列与木糖异构酶结构域(PLN02923)有较高相似性,其E-value为0×100 。该蛋白具有木糖异构酶显着特征,同时在序列中发现了可能的酶活性位点(His147)以及7 个金属离子结合位点,分别为Glu277、Glu313、His316、Asp341、Asp352,跨膜区域疏水区锚定到ER膜(其可信度系数为5.5)。
 
  3、重组质粒pGEX4T-1-LbxylA的构建与鉴定
 
  将PCR产物酶切纯化后,连接至pGEX4T-1载体多克隆位点,转化DH5α感受态细胞,挑取单菌落进行菌落PCR和双酶切验证,均能检测到目的条带,且测序结果正确,表明重组质粒pGEX4T-1-LbxylA构建成功。
 
  4、枸杞融合蛋白在大肠杆菌中的表达及抗体制备
 
  重组质粒pGEX4T-1 -LbxylA得以表达,且在77?kDa左右的位置有特征蛋白条带出现,与理论大小76.2?kDa基本相符,说明融合蛋白中LbxylA蛋白得到表达。进一步发现1号克隆和3号克隆的表达水平相对较高,随后选取1号克隆进行下一步研究。
 
  5、枸杞果实中LbxylA表达分析
 
  随着果实发育进程LbxylA相对表达量整体呈现出下降的趋势,其中,在果实发育前期(开花后约0~15 d)果实中LbxylA表达量急剧下降,但在果实发育中后期(开花后约22~36 d)果实中的LbxylA表达量维持着恒定水平。
 
  讨 论
 
  研究发现,在细胞体内木糖异构酶将木糖异构化为木酮糖,被应用在木质纤维素微生物发酵生产乙醇;另外,在体外木糖异构酶可将葡萄糖催化为果糖的异构化反应,这被大规模应用于高果糖浆的工业生产。将细菌的xylA基因导入到马铃薯块茎后,马铃薯块茎中己糖组成发生改变,从而对马铃薯的新陈代谢产生一定的影响。在本研究中,在果实的发育前期,果实中LbxylA的蛋白水平滞后于该基因相对表达量,但在果实发育中后期两者变化相一致,这表明枸杞果实发育的不同阶段LbxylA由于基因翻译及翻译后加工,使该基因存在时空间的差异,此外,LbxylA变化是否还与果实中糖含量高低有关,有待于进一步研究。
 
 
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