1、PCR产物自身原因：
往往由于酶量过多或酶的质量差，dNTP浓度过高，Mg2+浓度过高，退火温度过低，循环次数过多，而造成PCR的非特异性产物过多。
对策：
①减少Taq酶的量，或调换另一来源的酶。
②减少dNTP的浓度。
③适当降低Mg2+浓度。
④增加模板量，减少引物的用量，减少循环次数，提高退火温度。
2、电泳体系的问题：
（1）电泳缓冲液TAE或者TBE的污染，建议更换缓冲液。（2）上样时样品漂了，建议增加上样缓冲液的用量，以及小心加样。
（3）电压太高。
（4）适当把你的胶的浓度加大。（根据你的片断大小而定）（5）观察你的marker是否也存在拖尾现象，作为对照。
PCR拖尾及假阳性的原因及对策
拖尾
现象：产物在凝胶上呈Smear状态。
原因：
1.模板不纯
2.Buffer不合适
3.退火温度偏低
4.酶量过多
5.dNTP、Mg2+浓度偏高
6.循环次数过多
对策：
1.纯化模板
2.更换Buffer
3.适当提高退火温度
4.适量用酶
5.适当降低dNTP和镁离子的浓度
6.减少循环次数
假阳性
现象：空白对照出现目的扩增产物
原因：
靶序列或扩增产物的交叉污染
对策：
1.操作时应小心轻柔，防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外；
2.除酶及不能耐高温的物质外，所有试剂或器材均应高压消毒。所用离心管及加样枪头等均应一次性使用。
3.各种试剂最好先进行分装，然后低温贮存
