使用粗粒度分子动力学模拟，比利时布鲁塞尔自由大学的F.Van Liefferinge、E.-M.Krammer等人研究了VDAC对小无机阴离子选择性的两个依赖因素：离子强度和脂质组成。与实验数据一致，研究者发现VDAC对阴离子的选择性随着盐浓度的增加而降低，这是由于筛选了指向孔腔的一些碱性残基。分子动力学模拟揭示了脂质膜组成对VDAC选择性的调控机制，表明POPE对VDAC选择性的调控作用与POPC双层不同。这通过位于β桶两边的酸性残余物与POPE的头基团更持久的相互作用而发生，POPE的头基团反过来影响静电势，从而影响孔的选择性。这种机制不仅发生在POPE单组分膜中，而且还通过POPE在VDAC表面的POPC脂质上富集，发生在混合的POPE / POPC双层中。
因此，研究表明，计算上廉价的粗粒度模拟能够以半定量的方式捕获VDAC阴离子选择性的基本特征，并且可以为了解天然膜中代谢物转运的分子水平铺平道路。
