1.标准结构的变化
采用HSL高级结构，与ISO9001保持一致，便于整合；
FSMS系统模型的变化（体系的PDCA和食品安全计划的PDCA）
2.FSMS管理原则的变化，强调质量管理7大原则同样适用
3.术语的变化，比旧版新增28个术语；对CCP、OPRP和PRP之间的区别作了明确的描述；4.明确了前提方案的引用标准：ISO/TS 22002族标准
5.强调基于风险的思维方法，加强组织层面的风险和运行层面的风险管理
增加理解组织环境（4.1）
增加理解相关方的要求（4.2）
增加风险和机遇的应对措施（6.1）
6.强调高层领导力和食品安全文化（5.1、5.2）
7.强调食品安全目标可实现性（6.2）
8.工作环境强调人为因素和物理因素（7.1.4）
9.增加对外部开发的FSMS要素的控制（7.1.5）
10.强调对外部提供过程、产品和服务的控制（7.1.6）
11.强调对追溯系统的有效性进行验证（8.3）
12.强调对应急准备和响应程序的测试（8.4）
13.原料、辅料和产品接触材料描述中增加“来源”一项（8.5.1.2）
14.增加对加工环境的描述（8.5.1.5.3）
15.OPRP和HACCP均属于危害控制计划，对建立OPRP的描述更具体（8.5）
16.强调是针对PRPs和危害控制计划的验证（8.8）
17.产品 撤回改为产品撤回/召回（8.9.5）
18.管理评审输入新增内容（9.3）
