1． 流动相选择原则：
1） 针对待分离样品的极性，选择极性适中的两种或三种试剂；
2） 两相需互溶；
3） 对人体伤害小；
4） 截止波长低（防止覆盖样品峰）。
对于制备色谱，还需多加几条：
5） 流动相易挥发（容易除溶剂）；
6） 粘度低（不易超压）；
7） 不会损害色谱柱及泵（高比例甲醇会引起硅胶填料流失，高比例水相会使氨基键合硅胶填料水解，二氯甲烷会腐蚀泵等金属）；
8） 不会使样品变质；
9） 对样品有较好的溶解性。
2. 正相常用色谱流动相组合：
正己烷-二氯甲烷；正己烷-乙酸乙酯；正己烷-乙醇；正己烷-异丙醇；二氯甲烷-乙酸乙酯；二氯甲烷-甲醇。
3. 反相常用色谱流动相组合：
水-乙腈；水-甲醇；甲醇-乙醇；甲醇-二氯甲烷；乙腈-二氯甲烷；
常规情况下，将流动相中加少量酸，调pH至3左右，以抑制固定相中残留硅羟基作用，改善峰型；有时分析生物碱类样品，需将流动相调为碱性（选用耐碱色谱柱）。
对于色谱方法开发工作者，应根据样品信息，灵活选择流动相。
4. 常用试剂极性大小
水>甲醇>乙腈>丙酮>乙醇>异丙醇>乙酸乙酯>四氢呋喃>二氯甲烷>正己烷
