液质联用灵敏度受许多参数的影响，故障排除起来相对来说有点复杂。故障排除原则是先从简单的部分开始。
首先，要检查的内容包括以下三点：
1. 方法
“方法”包括液相方法、质谱方法、调谐文件、进样体积等这些跟数据采集相关的仪器方法及参数。仪器方法变更条件时，由于名称相同而会被覆盖，必须仔细查看文件里的参数是否与之前的条件相同。
2. 流动相和样本
“流动相和样本”，液相使用的流动相是否有变化，样本的浓度是否出错？溶解样本的溶剂是否变化？
3. 流动相变质
“流动相变质”，特别是水相流动相放置时间过长，会产生很多污染物，甚至是长菌。
其次，如果能区分液质故障发生在液相仪器一侧还是质谱仪器一侧，会有助于更快的恢复故障。确认故障侧有以下两个方法：
1、液质系统如果同时配置了紫外检测器，将液质系统同时连接紫外部分做测试，如UV检测的结果正常，则问题应在于MS侧。
如UV检测结果中未明确显示峰值，则问题应在LC侧。LC侧影响灵敏度的主要是流动相污染或改变，以及样品进样量。样品注射器有气泡、进样针堵、液相管路有漏液都会影响灵敏度。
2、流动注射标准品（通常是质谱的"setup solution"，即标准性能检查溶液）进质谱，检查质谱峰的峰高（代表峰响应绝对强度）、半峰宽（代表分辨率，四极杆质谱定量方法推荐半峰宽为0.75Da左右）、峰位置（代表质量准确度）。性能检查能快速确定质谱仪是否存在峰响应强度、分辨率或质量准确度方面的问题。峰强下降可能跟离子源污染、毛细管污染或堵塞、质谱真空度不够有关。分辨率设置过高，质量数漂移会影响目标质量离子检测强度。
小贴士
质谱离子源
质谱离子源是最易污染的区域，因而清洗离子源是经常性的工作。大量的或过浓的样品分析，会导致在锥孔处污染物的堆积和离子源通道离子轰击的沉积物留痕，结果均会造成离子传输效率下降，从而仪器灵敏度下降。离子源污染，必须进行清洗。考虑到污染的可能性顺序，清洗顺序依次是一级锥孔及锥孔套、离子源块、离子透镜。
通过上述故障排查步骤，可以快速找到液质灵敏度下降的本质原因，再根据原因采取相应措施，可以让仪器的检测状态尽快恢复到正常水平。
常见故障之不出峰
液质联用不出峰受许多参数的影响，故障排查思路与之前灵敏度下降排查相类似，依然先从简单的部分开始。
1、检查内容
方法：包括液相方法、质谱方法、调谐文件等这些跟数据采集相关的仪器方法及参数。仪器方法变更条件时，由于名称相同而会被覆盖，必须仔细查看文件里的参数是否正确。例如：质谱方法电离极性，目标母离子，子离子等设置错误会造成不出峰。
流动相和样本：液相使用的流动相是否有变化，样本是否出错，进样瓶位，样品量是否够进样？溶解样本的溶剂是否变化？
流动相变质：特别是水相流动相，放置时间过长，会产生很多污染物，甚至长菌。污染的流动相和系统，对质谱电离效率影响很大，造成不出峰。
特殊操作：即发生故障之前是否经过某项特殊操作（离子源清洗、部件更换等），故障可能是由于该操作所致 。
2、确认故障侧
能区分不出峰的故障发生在液相仪器一侧还是质谱仪器一侧，会有助于更快的恢复故障。
确认故障侧的方法
液质系统如果同时配置了紫外检测器，将液质系统同时连接紫外部分做测试。如UV检测出峰，则问题应在于MS侧；如UV检测不出峰，则问题应在LC侧。
流动注射质谱性能测试标准品进质谱检查是否出峰。如果不出峰，则问题是MS侧；反之则为LC侧嫌疑更大。
在确定故障侧后，如果LC侧嫌疑更大，则重点检查以下三点：
a）如果液相系统压力很低，可能的原因是液相未输送液体或色谱柱前漏液；
b）液相系统的色谱柱前、柱后、直至连接质谱流路阀的各管路接口，连接探头的管路接口是否有漏液；
c）质谱流路阀阀位是否在waste（排废）状态？特别是质谱方法是否设置了方法事件，将出峰时间段切去waste？
反之，如果是MS侧的故障，则重点检查以下三点：
a）一级锥孔处的真空隔离阀位置是否处于关闭；
b）观察质谱离子源的喷雾，正常的喷雾应该是连续稳定的；
c）质谱电压反馈值，特别是诊断界面的电压参数，重点检查毛细管反馈电压、光电倍增器的反馈电压等。
通过上述的故障排查具体步骤，可以快速找到液质联用不出峰的本质原因。然后再根据原因采取相应措施，即可让液质联用仪器的检测状态尽快恢复到正常水平。
