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多平台组学分析:揭示人类宿主对埃博拉感染反应的生物标志物

放大字体  缩小字体 发布日期:2017-11-28
核心提示:在这项研究中,上周在发表在《细胞宿主和微生物,威斯康星-麦迪逊大学的研究人员,太平洋西北国家实验室,东京大学,大学的塞拉利昂和其他地方进行了多平台组学分析的多个EVD患者外周血单核细胞和血浆检测生物标记对致命的埃博拉病毒病例。
   纽约(GenomeWeb)——一个国际研究小组评估了埃博拉病毒疾病患者的血浆分子和周围免疫细胞的变化,强调了EVD发病机制和未覆盖的假定生物标志物,以预测EVD结果。
 
  在这项研究中,上周在发表在《细胞宿主和微生物,威斯康星-麦迪逊大学的研究人员,太平洋西北国家实验室,东京大学,大学的塞拉利昂和其他地方进行了多平台组学分析的多个EVD患者外周血单核细胞和血浆检测生物标记对致命的埃博拉病毒病例。
 
  研究人员在初步诊断后从EVD患者采集样本,包括幸存者的连续样本;患者在死亡前的最初样本中死亡;和健康控制样本。该小组总共获得了11名EVD幸存者的29个样本和9个EVD死亡病例的9个样本。
 
  研究小组最初发现,EVD幸存者的白细胞介素- 6(il - 6)、肿瘤坏死因子(TNF)和白细胞介素- 10(白细胞介素- 10)的水平显着升高。在致命的EVD病例中,血浆il - 6和TNF高于EVD幸存者。研究人员认为,EVD死亡可以“通过病毒载量和血浆细胞因子水平在入院时区别于幸存者”。
 
  研究人员接下来研究了一个血浆代谢组学数据集,以确定与EVD患者的临床结果相关的代谢特征。除了葡萄糖和果糖,他们只在EVD死亡中看到血浆游离氨基酸(PFAAs)的急性减少。在这些病例中,PFAA水平的下降暗示了免疫细胞的激活。
 
  血浆脂质学分析强调了脂质子类的改变,这些子类定义了EVD和致命的EVD。在死亡中,与幸存者相比,某些脂类和神经酰胺种类增加,而LPC物种显着下降。
 
  研究小组随后使用途径富集分析研究了一种血浆蛋白质组数据集。他们发现宿主的巨噬细胞和中性粒细胞对EVD有反应,在致命病例中更为明显。此外,他们还观察到可溶性VSIG4的增加,这是一种“在巨噬细胞上表达的刺激分子,只在死亡中”。
 
  此外,研究人员还发现了骨髓细胞趋化因子受体(CCR1和CCRL2)和其他巨噬细胞特异性受体转录本的显着变化。因此,他们认为骨髓细胞可能会对致命的EVD坏死,由于血液循环中TNF含量丰富,增加了pro -caspase- 8分裂抑制剂CFLAR的表达,并增加了坏死下垂调节剂MLKL的表达。

  研究人员还发现,在EVD中出现的低密度中性粒细胞(LDN)导致了免疫诱导的适应性免疫失调,并增强了与疾病相关的组织损伤。LDNs释放中性粒细胞外捕集网(网),它通过诱捕微生物和限制它们的传播来促进宿主防御。然而,过度的净形成会导致组织损伤。释放更高比例的五核组蛋白(MPO,CTSG,PRTN3,AZU1)可能导致炎性疾病,最终导致EVD患者死亡。
 
  此外,研究人员发现,在EVD死亡的血浆中,胰腺acinar细胞分泌的几个因子的水平升高。由于严重的EVD和急性胰腺炎的症状在行为上相似,研究小组认为ebola诱导的胰腺组织损伤和胰腺酶的释放可能在EVD发病中起作用。
 
  作者说:“研究结果表明,在现实生活中,冗余生物标志物的组合可能有助于确保准确的结果预测,而这反过来又可能改善最危险的病人的预后。”
 
 
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