多亏了代谢组学，我们现在有了“测序”的人类血液，还有尿样代谢组，它们在单细胞层的代谢组学中得到了蓬勃发展，并将其作为系统生物学对生命理解的工具。代谢组学现在被认为是一种整合的工具/方法，以人类血液代谢物作为基因组的预测因子，或通过基于个人、密集、动态数据云的个人健康研究。
作为一名代谢组学研究员，我不仅对它的科学感兴趣，而且总是想知道其他早期职业研究人员(ECRs)是如何应对挑战或吸收技术的。考虑到这一点，我最近赶上了一个成功的ECR，领导了一个由代谢组学和微生物学研究人员组成的团队，Vanessa Phelan博士。费兰博士是科罗拉多大学药学系的L.S.斯卡格斯助理教授。这是她在代谢组学的学术生涯中的经历:
01
什么技能、专业知识和人脉帮助你达到了目前在代谢组学领域的位置?
我在范德比尔特大学(Vanderbilt University)的研究生工作期间接受的质谱训练和我在加州大学圣地亚哥分校(University of California,San Diego)的博士后工作，为我目前的专业知识提供了许多实验基础。我在代谢组学中所占的特殊位置，很大程度上是由于我在质谱、天然产物和微生物学方面的跨学科性质。在联系和机会方面，NIH的代谢组学倡议提供了资金和网络机会，这些机会极大地影响了我在这一领域的地位。
02
你认为你是如何影响我们的世界和人民的?，社区，同事等等)通过你的旅程?
我认为我给微生物学界带来了化学知识。在许多情况下，微生物学家有证据表明有一个小分子驱动的表型，但不知道如何去追求化学物质的特性或结构。我的团队充满了对化学专业知识的需求。
03
作为一个ECR，你对代谢组学最重要的贡献是什么?
全球自然产品社会分子网络，也称为GNPS(GNPS。ucsd。edu)。GNPS是一种生物信息学平台，使用串联质谱的MS / MS数据作为化学结构的代理。这一工作流程允许研究人员将他们的数据组织到分子家族中，以便更容易地进行代谢物注释和模拟发现。GNPS绝对是一个很大的团队努力，需要来自不同专业领域的人的合作。我认为这个平台最酷的一面是，来自世界各地的研究团队正在整合许多不同的平台和GNPS。令人惊讶的是，全球代谢组学社区正在合作提供开源工具和平台。
04
是什么时刻或工作帮助你从ECR过渡到专业的?基本上，你的职业生涯的决定性时刻?
我不认为自己是一个“专业”的人，因为总是有新的工具、方法和技术从metabolomics社区的工作中涌现出来。
05年
你能指出一些资源，这些资源有助于提高代谢组学中所有ECR的技能吗?
如果你想在代谢组学方面表现出色，你必须执行代谢组学——从样本准备到数据采集、特征查找、注释和统计分析。许多学术中心都开设了代谢组学的课程和讲习班，以提供对工作流程的洞察。此外，还出版了关于实验工作流程的综述和手稿。然而，已经有几十种工具被单独开发，而社区还没有达成任何形式的共识，哪些工具是最好的。metabolomics工作台有一个可用的数据库和工具列表，尽管这个列表并不详尽。metabolomics协会也有教程和链接到可用的软件、数据库和标准。
六
代谢组学如何重塑世界?
代谢组学当然提供了另一个维度来理解生物过程，在某些情况下，还能洞察代谢疾病。与包括其他经济学技术在内的基础和临床研究一起，我认为代谢组学将继续增加我们对我们世界的理解。
据我所知，代谢组学成功地欢迎了几乎所有科学和基础研究领域的专家。她的故事是另一个很好的例子，说明了如何在他们的军械库中使用代谢组学作为一个工具取得成功。对于那些冒险进入代谢组学研究的业余爱好者来说，我已经在这里列出了额外的资源，metabolomics协会也有指导和标准来报告代谢组学研究的指导方针。有了Phelan博士的洞察力和这些工具，ECRs有能力丰富他们自己的代谢组学的工作。
引用:
Psychogios,N。,Hau号彭,J。郭,交流Mandal,R。、Bouatra年代。Sinelnikov,我。?R。艾斯纳,R。，高塔姆，b，杨，N。,2011年。人类血清代谢物。PLoS One,6(2),p.e16957。
Bouatra,S。Aziat F。Mandal,R。郭,交流威尔逊,核磁共振诺克斯,C。Bjorndahl,教学楼。?R。,萨利姆,F。刘，p和Dame,z . t,2013年。人类的尿液代谢物。《公共科学图书馆?综合》,8(9),p.e73076。
Fessenden,M。,2016年。代谢组学:小分子，单细胞。自然,540(7631),与155年。
5月,M。,2017年。大数据，大图:代谢组学与系统生物学相遇。科学,356(6338),pp.646 - 648。
Misra,博博。,2016年。做代谢组学研究的快速技巧(不是。e2002v1)。PeerJ预印本。
Fiehn,O。罗伯逊,D。格里芬,J。范德维尔夫，M。,Nikolau B。莫里森,N。萨姆纳,lGoodacre,R。哈迪,净重。泰勒，c .和Fostel,J。,2007年。metabolomics标准倡议(MSI)。代谢组学,3(3),pp.175 - 178。
长,T。希克斯,M。Yu,H.C.比格斯,诗人、Kirkness E.F.Menni C。Zierer,J。小,K.S.Mangino,M。梅西耶，h .和布雷沃顿。,2017年。全基因组测序确定了与人类血液代谢物相关的常见变异。自然遗传学,49(4),pp.568 - 578。
菲尔特价格魔法师,A.T.伯爵,J.C.Glusman,G。Levy,R。Lausted C。麦当劳,D.T.Kusebauch U。苔藓,中一段周，和秦，S。,2017年。一项针对108个人的健康研究，使用个人、密集、动态的数据云。自然生物技术,35(8),p.747。
