益生元是指能够选择性地促进宿主肠道内原有的一种或几种有益菌生长繁殖而且不被宿主消化的物质，通过有益菌的繁殖增多，抑制有害细菌生长，从而达到调整肠道菌群，促进机体健康的目的。益生元有稳定性好、热量低、服用量小、配伍性好的特点，用其开发健康食品有以下几个思路。
代餐粉 以谷物、豆类、薯类为主要原料，辅以益生元，如低聚果糖、低聚异麦芽糖、低聚木糖等的一种或几种，可以开发出代餐粉产品。代餐粉产品具有食用方便等特点。
添加益生元的益生菌产品 “益生元+益生菌”是目前较为流行的产品，在补充益生菌的同时，补充可增殖肠道有益菌的益生元，双管齐下，效果较好。如某款产品添加了两种益生菌嗜酸乳杆菌和乳双歧杆菌，再复配益生元低聚木糖。
益生元饮品 益生元饮品包括在水、饮料、茶、咖啡中添加益生元，低聚糖类益生元都有甜度，一方面可部分替代饮品中的甜味剂调节口感，另一方面是热量低，可减少热量的摄入。
