1平皿法
传统的微生物检测方法，主要有：划线、涂布和倾注。直接将样品置于培养基上或培养基中进行培养观察。
划线法适合做阳性菌接种，同时适合对单一菌落进行分离且聚落形态呈线性生长，但划线法的操作难度大，容易将琼脂划破，而且不同菌落使用不同接种环，容易交叉污染。
涂布法是一种简单快捷、可用于固体等不可过滤样品、适合广泛的选择性琼脂传统的微生物检测方法 但它存在技术不准确、样品体积有限、无法除去抑制剂等缺点。
倾注法与涂布法相似，优点是简单快速，适合广泛的选择性琼脂，可用于固体等不可过滤样品，缺点是样品体积有限，无法除去抑制剂，无法观察到典型菌落形态，技术不准确，容易连片。
2MPN法（最大可能数法）
也称稀释培养计数，制备3个连续稀释级供试液，每一稀释级取3份1mL分别接种至3管液体培养基中，培养后观察是否有微生物生长，根据微生物生长的管数从表中查需氧菌总数的最可能数。
优点：
传统方法
广泛的选择性液体培养基
用于不同性状类型的产品
缺点：
工作量大
多步稀释和操作
额外的准备和清洁时间
无法计数(微生物的可能数量)
需要附加实验确认
3薄膜过滤法
膜过滤法所采用的滤膜孔径应不大于0.45pm（该孔径可以有效截留90%以上的微生物），直径一般为50mm。供试品及其溶剂应不影响滤膜材质对微生物的截留。使用时，应保证滤膜在过滤前后的完整性。应注意保持供试品溶液及冲洗液覆盖整个滤膜表面，从而使滤膜发挥最大过滤效率。
优点：
可将抑菌物质冲洗掉
可测试大体积样品
统计学意义上更可靠
敏感度高，可达1CFU
缺点：
只适用可过滤样品
固体颗粒可能会堵膜
总结：
根据不同的样品选择合适的方法检测，能够更加客观的反映样品中微生物的含量，从而制定相应的内控参数以符合样品放行的标准。
