由于水稻种子易依附稻瘟病、恶苗病、胡麻斑病、黑粉病等病菌，在水稻播种前应对水稻种子进行消毒，这是防治水稻稻瘟病、恶苗病、立枯病、胡麻斑病等有效措施。具体消毒方法如下：
1.为提高种子发芽率，应在浸种前晒种半天。
2.药剂消毒：种子先用清水预浸12小时，然后捞起放入配好的“使百克”1000倍液（即以每包“使百克”0.6毫升对水2斤，浸种3斤）中再浸24小时，浸后不需清水冲洗可催芽播种或用800倍多菌灵液浸种24小时或用500倍强氯精液浸种12小时，浸后用清水洗净再催芽。
二、水稻主要有哪些病虫害？如何科学防治？
（一）水稻主要病害有：稻瘟病、纹枯病、细条病、恶苗病、普矮病等。
1.稻瘟病：分苗瘟、叶瘟、穗颈瘟。凡栽培感病组合（品种）偏施或迟施过量氮肥，长期深灌、冷水灌溉、孕穗期和抽穗期受旱或长期阴雨或雾气重，发病常较重，应注意防治。防治上首先做好种子消毒，加强肥水管理；药治可亩用仙耙稻丰收100克或施稻灵30毫升或瘟立克30克或正宗上海产10%三环唑100克，配水60公斤细喷雾。防治穗颈瘟应于水稻破口10%为防治适期。
2.纹枯病：凡高温高湿、氮肥过多、稻株生长茂密浓绿、通风透气差，多雨及长期深水灌溉等发病常较严重。防治上应加强肥水科学管理，药治上可亩用20%纹枯净粉剂50克或满穗15毫升或3%井岗霉素水剂300毫升，配水60公斤喷雾。
3.细条病及白叶枯病：凡稻株生育过旺，又处在幼穗分化至抽穗的较易感病生育期，一旦遇上台风暴雨或雨日多、雨量大、受淹田病害会迅速蔓延，扩大危害。药治可选亩用消病灵40克或施稻灵50毫升或消菌灵40克或菌毒清50克，配水60公斤细喷雾。
4.稻曲病：主要危害谷粒成墨绿色粉块团，影响产量和米质，对人畜有害，药治可选亩用仙耙稻丰收100克或23%满穗悬浮剂5ml或20%瘟曲克星可湿性粉剂100克，配水60公斤于水稻破日前3—5天细喷雾。
5.恶苗病：秧苗徒长。关键在于种子消毒。
6.普矮病、黄矮病：主要是稻株矮缩、分蘖增多或丛簇状、叶色特浓绿（或黄化），不能抽穗。由叶蝉传毒造成。关键在于治虫防病。
（二）水稻主要虫害有：螟虫、稻飞虱、稻纵卷叶螟、稻瘿蚊、农田鼠害等。
1.螟虫：包括三化螟、二化螟、大螟。
2.三化螟近年有上升趋势。
3.危害造成枯鞘、枯心和白穗。药治选亩用20%三唑磷100毫升或40%稻康EC60—80毫升或特杀螟50毫升或杀虫安（虫杀手）水剂200—250毫升配水60公斤喷雾。防白穗关键要打破口药。
4.稻飞虱：包括白背飞虱、褐飞虱。成虫若虫群聚集稻丛基部危害造成茎叶发黑，基部黑褐色，叶尖棕红、叶片枯黄，严重的烂秆倒伏，影响抽穗结实。防治上：①加强肥水管理；适期搁田，降低田间湿度。②药治可选亩用25%阿克泰水分散粒剂2克或2.5%扑虱灵可湿粉30克或大功臣可湿粉15克配水60公斤喷雾。
5.稻瘿蚊：由间歇性、区域性发生，近已成为连续性、普遍性发生的主要害虫。其幼虫危害造成稻出葱。稻瘿蚊发生轻重与冬季气温高低及温湿度有很大关系。
防治上要开展综合防治：①冬季翻耕晒白，铲除越冬虫源寄主；②实行改制避蚊；③药治可选亩用10%益舒宝或10%益舒丰或10%绿收宝颗粒剂1.25公斤或30%呋喃丹3公斤或8.5%稻龙宝1.25公斤或稻瘿蚊展膜剂120—150毫升或3%米乐尔颗粒剂1.5公斤拌细砂土30公斤均匀撒施。关键在施药适期，秧田于一叶一心期，本田于移栽后5—7天，药前要保持寸水以上5天。
6.稻纵卷叶螟：该虫一年发生五代，全年以第二代至第四代造成的危害较严重。药治可选亩用40%稻康乳油50毫升或特杀螟可湿性粉剂50克或20%三唑磷100毫升或杀虫双200毫升或20%百虫光乳油30—60毫升配水60公斤喷雾。
7.鼠害：近年来农田鼠害日趋严重。开展农田灭鼠，减少鼠害损失，是增粮增收的一条重要措施。应加大农田灭鼠宜传力度，实行五统一灭鼠，做到稻田、经作地、食用菌场所、旱地、农舍灭鼠同步进行，实施科学灭鼠，大力推广应用高效、安全、无二次中毒的新灭鼠药7.5%杀鼠迷水剂，严禁使用氟乙酰胺、毒鼠强、甘氟等剧毒鼠药
