与非抗虫棉相比，抗虫棉有效控制了棉铃虫的危害，蕾铃脱落量减少，结铃早而多，势必造成养分大量消耗，容易引起早衰；抗虫棉对土壤肥力条件要求高，需要增施肥料提高地力和平衡施肥，否则会引起早衰。对于棉花早衰，必须及早采取措施预防，确保棉花丰收。
早发棉田摘除早蕾。抗虫棉现蕾开花早，在植株尚未搭好丰产架子前，叶片制造的营养物质大部分都供给生殖器官，导致营养生长受到抑制，引起早衰。6月中下旬，将棉株下部第一至第四果枝上的早蕾摘去4-8个，这样可以协调营养生长和生殖生长，有效防止早衰。
蕾期适时适量施肥浇水。棉花一般在6月中旬前后现蕾，此时正处于高温干旱阶段，影响棉花发棵搭架，因地制宜适时浇水，可以促进植株根系下扎，防止早衰。针对当前多数棉田地力较差、底肥施用不足，抗虫棉苗期和蕾期长势弱的情况，可以在现蕾初期每亩施尿素7-9公斤，促进发棵搭架。此外，土壤墒情不足浇水后要适时中耕保墒。
花铃期防旱防涝防脱肥。花铃期是棉花需肥需水的高峰期，如果肥水供应不足，极易引起早衰。抗虫棉对肥水反应敏感，开花结铃集中，花铃肥应提早到初花期施用，用量要适当增加，一般每亩施三元复合肥15-20公斤。7月下旬至8月初，可以叶面喷施氮磷钾化肥溶液2-3次，防止早衰。结合施肥浇水，遇旱及时浇水，一般遇7-10天高温无雨天气就要立即浇水1次。棉花花铃期正值雨季，常出现暴雨，易造成棉田积水，要及时排除积水，以免根系缺氧而早衰。
养根保叶。棉花进入生长中后期，养根保叶是预防早衰的重要措施。抗虫棉的营养枝一般出生少而弱，整枝可以只打顶心，保留营养枝，增加光合面积，以制造更多的养分，促进植株生长。开花后不宜深中耕，以免伤根引起早衰。
科学使用农药。抗虫棉通常只抗棉铃虫，如果中后期伏蚜、红蜘蛛和红叶茎枯病等病虫害发生较重，必须及时喷施农药防治。施药浓度不宜过高，避免伤害叶片，以延长叶片功能期，防止棉花后期早衰。
