棉花是一种耐涝性较强的作物。据观察，棉株受淹48-72小时，排水后植株完好；受淹十几天，叶子全部脱落，主根烂掉一半，仅生长点未死，把水排除后及时管理，20天后，棉株可恢复生长；随淹随排，棉花能20多天不死且有收成。可见，受涝棉花只要生长点不死，涝后及时加强田间管理，仍能获得较好收成。综合各地经验，管理遭受涝灾的棉花贵在“五及时”：
1.及时排除积水。虽然棉田积水后，植株仍能生长，但淹水时间过长，会严重影响根系活动，容易造成大量叶片和蕾铃脱落，必须在可能的情况下及时排水，尽量减少田间积水时间。
2.及时扶苗、洗苗。棉花经过水淹和风吹，根系受到损伤，往往造成棉株倒伏，排水后必须及时扶正、培直，并洗去叶片及枝条上的淤泥，以利进行光合作用，促进植株生长。
3.及时中耕、培土。受涝棉田排水后土壤板结，通气不良，水、气、热状况严重失调，必须及早中耕，破除板结，并结合中耕进行培土，以提高植株根际的土壤温度和防止倒伏。
4.及时增施肥料。棉田经过水淹，土壤养分大量流失，加上根系吸收能力衰弱，及时追肥对棉株恢复生长和增结秋桃十分有利。在棉株恢复生长前，以叶面喷肥为主；棉株恢复生长后，可在距棉株10-13厘米处，开沟(穴)追施碳铵10-15千克／亩或尿素5-7.5千克/亩。
5.及时防治病虫害。受灾棉株恢复生长后，枝叶幼嫩，前期蚜虫多，后期易受棉铃虫、棉小造桥虫等为害。因此，要早治、狠治，做到每叶必保，每蕾（铃）必争，最大限度地提高单株产量。同时，由于受涝棉田田间湿度大，容易引起烂铃，要切实加强防治。另外，遭受涝灾的棉花要适当推迟打顶时间（一般要比正常棉花晚打顶5-10天），遇秋旱及时浇水，后期适时进行人工催熟。
