发酵罐灭菌之后，就可以用来培养细菌了。
1.接上pH电极的插头, 接通底部冷却水管和空气出口处的冷凝器上的冷却水管, 将各硅酮管置于相应的蠕动泵上。
2.把搅拌马达置于搅抖联动装置上。
3.把光标调到“Temperature”档,设定一个合适的温度。
4.校正溶氧电极的满刻度。
1)利用光标将搅拌速度调至最大转速，一般为800 r/min,把通气量调节到1.0 L Air/L medium/min(1VVM)。
2)调到calibration界面，光标调至溶氧处，“span”档,设定读数为100，反复调节几次，直至稳定至100，转至menu界面。
5.其他参数设定。把光标调到Agit档，设定最小值为200 r/min。把光标调到DO档,设定参数为合适的值, 调整为与溶氧偶联检测。把光标调到Agit档，设定最大值为800 r/min;把光标调到pH档,设定参数为7.0，调整为自动检测;接上酸(碱)瓶，并打开自动检测系统。
6.接种：发酵罐的接种就是将蘸满乙醇的棉花球缠在接种口外套上, 点燃火焰以前将接种口的盖子旋松。然后点燃发酵罐上的棉花球, 取掉盖子, 立即在火焰中加入各组分培养基和种子液。最后将盖子浸泡在乙醇中, 接种后, 用摄子将盖子准确放回原位, 旋紧。
7.打开记录实验过程的专用软件。
8.发酵过程中，每隔两小时记录溶氧、转速、测定OD600，取样品5 mL储存进行各种分析检测。
认真的对照上面的步奏进行，发酵缸的操作就顺利完成了。
二、发酵罐的清洗的注意事项
发酵罐的清洗是非常重要的，但是很多人不太会，不但没有清洗干净，反而可能导致更恶劣的后果。
1.发酵过程会产生大量的蛋白质、酒花树脂、多糖、酵母等有机物和草酸钙、硫酸盐等无机物，在发酵罐清空后，有机物和无机物污物附着在罐壁上，呈黄褐色。酒石数量多时，表面呈现白色，如同盐碱地表皮一样，无机物与有机物相互交织在一起。
清洗时使用火碱，只是对去除有机物有作用，清洗温度达到80℃以上，才会有较好的清洗效果。
清洗时采用单一的硝酸进行清洗，只是对无机物有一定效果，对有机物几乎无效。而发酵罐壁所结污物为无机物和有机物的混合物，使用单一清洗剂清洗困难。因此，有的啤酒厂每年都会对发酵罐进行一次大清洗，彻底清刷发酵罐。
2.发酵罐壁T541防腐层部分损坏，经修补后，表面光洁度明显下降，造成罐壁污物清洗困难。
3.洗罐器或洗球的磨损或堵塞，导致部分发酵罐清洗不彻底，污物积累较多。
诸多因素会致使发酵罐经过几年的使用后，会产生很多脏物质，比如罐壁积累了一定量的污物，使用常规清洗工艺难以彻底清除。故每4至5年，可利用生产淡季对发酵罐进行深度清洗。这是最好的方法。
