近日，Plant Journal 在线发表题为“Accurate measurement of transgene copy number in crop plants using droplet digital PCR.”文章，建立了适用的ddPCR检测外源基因拷贝数体系。
近些年由于定量PCR（qPCR）技术获得了突破性的发展，不仅结果更准确而且成本急剧下降。其相对与传统Southern杂交技术极低的成本、极短的试验周期以及较高的淘汰率（至少50%的转化苗为阴性或多拷贝），使得应用qPCR检测拷贝数成为了转化出苗后排在首位的检测项目。经过qPCR的筛选，后期基因表达、性状鉴定、田间调查的任务量将大大缩减。然而，由于qPCR检测拷贝数的结果不像Southern杂交那样绝对准确，它只能满足“低拷贝”的检测要求，至于“低拷贝”具体是一个还是两个拷贝，qPCR将很难给出确定的结果，因此仍然需要后期Southern杂交技术的辅助验证。
微滴式数字PCR（droplet digital PCR, ddPCR）技术的最大优势是能够确定核酸分子的绝对数目，因此它可能成为解决qPCR技术痛点的最好替代。该方法的应用将会使得拷贝数的筛选结果更加精准，从而导致整体筛选效率的大幅提升。最近，美国农业部的科研人员以水稻、柑橘、马铃薯、玉米、番茄、小麦这六个转基因技术广泛应用的主要作物为对象，分别建立了适用的ddPCR检测外源基因拷贝数体系。这将为这些作物优异转化体的创制工作带来极大的便利，同时为ddPCR技术推广到其他作物上提供参考。
