液质联用灵敏度受许多参数的影响，故障排除起来相对来说有点复杂。故障排除原则是先从简单的部分开始。
首先，要检查的内容包括以下三点：
1. 方法
“方法”包括液相方法、质谱方法、调谐文件、进样体积等这些跟数据采集相关的仪器方法及参数。仪器方法变更条件时，由于名称相同而会被覆盖，必须仔细查看文件里的参数是否与之前的条件相同。
2. 流动相和样本
“流动相和样本”，液相使用的流动相是否有变化，样本的浓度是否出错？溶解样本的溶剂是否变化？
3. 流动相变质
“流动相变质”，特别是水相流动相放置时间过长，会产生很多污染物，甚至是长菌。
其次，如果能区分液质故障发生在液相仪器一侧还是质谱仪器一侧，会有助于更快的恢复故障。确认故障侧有以下两个方法：
1、液质系统如果同时配置了紫外检测器，将液质系统同时连接紫外部分做测试，如UV检测的结果正常，则问题应在于MS侧。
如UV检测结果中未明确显示峰值，则问题应在LC侧。LC侧影响灵敏度的主要是流动相污染或改变，以及样品进样量。样品注射器有气泡、进样针堵、液相管路有漏液都会影响灵敏度。
2、流动注射标准品（通常是质谱的"setup solution"，即标准性能检查溶液）进质谱，检查质谱峰的峰高（代表峰响应绝对强度）、半峰宽（代表分辨率，四极杆质谱定量方法推荐半峰宽为0.75Da左右）、峰位置（代表质量准确度）。性能检查能快速确定质谱仪是否存在峰响应强度、分辨率或质量准确度方面的问题。峰强下降可能跟离子源污染、毛细管污染或堵塞、质谱真空度不够有关。分辨率设置过高，质量数漂移会影响目标质量离子检测强度。
小贴士
质谱离子源
质谱离子源是最易污染的区域，因而清洗离子源是经常性的工作。大量的或过浓的样品分析，会导致在锥孔处污染物的堆积和离子源通道离子轰击的沉积物留痕，结果均会造成离子传输效率下降，从而仪器灵敏度下降。离子源污染，必须进行清洗。考虑到污染的可能性顺序，清洗顺序依次是一级锥孔及锥孔套、离子源块、离子透镜。
通过上述故障排查步骤，可以快速找到液质灵敏度下降的本质原因，再根据原因采取相应措施，可以让仪器的检测状态尽快恢复到正常水平。
常见故障之不出峰
液质联用不出峰受许多参数的影响，故障排查思路与之前灵敏度下降排查相类似，依然先从简单的部分开始。
1、检查内容
方法：包括液相方法、质谱方法、调谐文件等这些跟数据采集相关的仪器方法及参数。仪器方法变更条件时，由于名称相同而会被覆盖，必须仔细查看文件里的参数是否正确。例如：质谱方法电离极性，目标母离子，子离子等设置错误会造成不出峰。
流动相和样本：液相使用的流动相是否有变化，样本是否出错，进样瓶位，样品量是否够进样？溶解样本的溶剂是否变化？
流动相变质：特别是水相流动相，放置时间过长，会产生很多污染物，甚至长菌。污染的流动相和系统，对质谱电离效率影响很大，造成不出峰。
特殊操作：即发生故障之前是否经过某项特殊操作（离子源清洗、部件更换等），故障可能是由于该操作所致 。
2、确认故障侧
能区分不出峰的故障发生在液相仪器一侧还是质谱仪器一侧，会有助于更快的恢复故障。
确认故障侧的方法
液质系统如果同时配置了紫外检测器，将液质系统同时连接紫外部分做测试。如UV检测出峰，则问题应在于MS侧；如UV检测不出峰，则问题应在LC侧。
流动注射质谱性能测试标准品进质谱检查是否出峰。如果不出峰，则问题是MS侧；反之则为LC侧嫌疑更大。
在确定故障侧后，如果LC侧嫌疑更大，则重点检查以下三点：
a）如果液相系统压力很低，可能的原因是液相未输送液体或色谱柱前漏液；
b）液相系统的色谱柱前、柱后、直至连接质谱流路阀的各管路接口，连接探头的管路接口是否有漏液；
c）质谱流路阀阀位是否在waste（排废）状态？特别是质谱方法是否设置了方法事件，将出峰时间段切去waste？
反之，如果是MS侧的故障，则重点检查以下三点：
a）一级锥孔处的真空隔离阀位置是否处于关闭；
b）观察质谱离子源的喷雾，正常的喷雾应该是连续稳定的；
c）质谱电压反馈值，特别是诊断界面的电压参数，重点检查毛细管反馈电压、光电倍增器的反馈电压等。
通过上述的故障排查具体步骤，可以快速找到液质联用不出峰的本质原因。然后再根据原因采取相应措施，即可让液质联用仪器的检测状态尽快恢复到正常水平。
液相色谱压力异常
液相系统压力产生的原因在于流动相流经管路及色谱柱时会有阻力，即所谓的反压或系统压力。
漏液会引起系统压力的降低，而堵塞会引起系统压力的飙升。
系统压力的单位有：巴(Bar)、兆帕(Mpa)和磅/平方英寸(psi)，它们之间的换算关系为1 Bar=0.1 Mpa=14.5 Psi。
1. 影响因素
影响系统压力的因素主要有流动相的溶剂组成、温度及流速这三方面：
1）流动相的粘度是产生反压的主要原因，下图为有机溶剂－水的粘度随组成与压力的关系图：
由上图可以看到，乙腈-水比例为（20：80）、甲醇-水比例为（40：60至50：50）时，系统的压力最大。因此，在做实验时应尽量避开这个比例范围。另外，异丙醇粘度大，一般不作流动相使用。
2）流速对反压的影响是线性关系，流速增加，反压亦增大。
3）温度对反压的影响是反比关系，温度升高，反压降低，对某些流动相的影响更大一些。
4）液相色谱仪各模块之间的连接管路也会产生压力，系统压力与管路的长度成正比，与管路直径的四次方成反比（1/D4）。上述考虑的是柱外因素对系统压力的影响，色谱柱对系统压力的影响也很大，反压与色谱柱长度成正比，与填料颗粒度的平方成反比（2.5μm填料比3.5μm填料反压高）。
2. 压力原因
具体到压力问题的表现形式上，主要有压力高、压力低或没有压力以及压力不稳：
①造成压力高问题的主要原因有：
1）温度太低；
2）流速太高；
3）流动相粘度大；
4）管路堵塞；
5）仪器或色谱柱堵塞；
6）压力传感器问题。
系统压力高的故障排除流程图如下：
②产生压力低情况的可能原因：
1）系统内有渗漏处；
2） 单向阀堵塞；
3）入口管路有气泡；
4）溶剂滤头堵塞；
5）所用溶剂不正确，储液瓶中无溶剂；
6）温度太高，流速太低；
7） 泵未输送流动相；
8）泵关闭或保险丝断了。
以上为仪器单向阀的结构示意图，如果某些原因造成宝石球与球基座发生黏结，造成液体不能进入到泵中，从而造成泵的压力偏低。
3. 造成压力波动可能的原因有：
1）脱气机排气不充分；
2）流动相未正确脱气；
3）所用溶剂不混溶或易挥发；
4）压力传感器及泵问题。
其中，大多数的压力波动都是由于气泡引起的（如下图）：
基线噪音问题
1.基线噪音大
1）流动相中有气体 – 溶剂脱气；
2）流动池中有气泡 – 在出口处使用0.009”的管路；
3）色谱柱上的污染物被洗脱 – 平衡系统，直至基线稳定；如样品中有保留非常强的组分，可设置强洗脱程序；
4）渗漏 – 此时应修复渗漏，重新连接或更换接头；
5）检测器灯能量低 – 更换灯；
6）灵敏度太高 – 使用合适的采样频率，调节增益（如ELSD检测器）；
7）检测器流动池脏 – 清洁流动池；
8） 电噪音 – 除去电噪音的来源：屏蔽电缆，清洁触点；
9）采样频率设置过大 – 一味追求高采样频率，可能对灵敏度没有任何帮助，同时也会产生比较大的噪音：UV检测器推荐降低采样频率，HPLC推荐1-5HZ，UPLC推荐20HZ。
2.同步的基线噪音
1）大多数情况下都是泵引起的，泵头中存在空气 – 将溶剂脱气，并重新灌注泵；
2）单向阀问题 – 超声清洗单向阀或更换；
3）柱塞杆断裂 – 更换；
4）混合问题 – 更换一个体积更大的Mixer，以增加系统体积；
5）电噪音 – 改变电路，除去来源。
3.不同步的基线噪音
1）气泡 — 流动相要脱气；
2）检测器中有气泡/空气 — 流动相脱气，或在检测器的后面加反压（不适用于RI检测器） ；
3）渗漏 — 特别是肉眼无法发现的微漏或者泵的内漏，会造成流速的变化和混合比例的变化，从而导致基线噪音，此时应修复渗漏，重新连接或更换接头；
4）管路堵塞 — 除去堵塞，冲洗系统；
5）电噪音 — 除去来源，改变电路。
4.基线漂移：上漂或者下漂
1）梯度变化引起，如溶剂B的吸收值高于溶剂A – 使用基线差减，或尝试新的流动相；
2）化合物从色谱柱上洗脱 – 平衡系统，直至基线稳定；如样品中有保留非常强的组分，可设置强洗脱程序；
3）溶剂改变（气体吸附，蒸发） – 氦气脱气，隔离溶剂；
4）溶剂渗漏 – 拧紧或者更换接头；
5）检测器温度影响（尤其是示差，电化学以及电导检测器） – 流动池温度调节；
6）柱温波动 – 等待柱温平稳，使用柱预加热器；
7）压力变化 – 过滤溶剂以及样品，或样品太粘稠；
8）混合问题 – 更换一个体积更大的Mixer，以增加系统体积。
5.Cyclic基线
1）温度影响 – 隔离热源，或搬离临近的通风口，或增加流动池温度；
2）混合问题 – 更换一个体积更大的Mixer，以增加系统体积；
3）流动相中的气体 – 溶剂脱气；
4）泵不稳定 – 检查维修泵；
5）管路堵塞 – 冲洗系统，排除并除去堵塞源头；
6）电问题 – 改变电路，或除去根源。
6.基线上的毛刺
1）气泡 – 溶剂脱气，并重新灌注泵，流动相脱气越好，基线就会越好；
2）信号连接不好，连线变松 – 清洁并拧紧检测器上的导线，或检查连线是否有损坏，或更换铲形接线片；
3）灯继电器试图点燃熄灭的灯 – 更换灯；
4）电噪音 – 更换电路，或除去根源。
7.小结
1）确保无电源及电噪音干扰；
2）为避免基线噪音，确保仪器系统内无气泡或空气，流动相首选过滤脱气；排尽管路、进样器、检测池中的气泡；选择合适的接头和管路，防止渗漏；
3）在编辑方法时，针对HPLC和UPLC仪器UV检测器设置合适的采样频率，HPLC推荐1-5HZ，UPLC推荐20HZ；
4）保持良好的操作习惯，如UPLC仪器水相流动相每天更换，添加了缓冲盐的流动相过0.2 μm溶剂过滤膜等，都会减小基线噪音的产生。
