Fat A
FatA在5.7um波长(波数450)处有吸收是由于脂肪里羰基C＝O键的伸缩振动。这种测定只关心脂肪分子的数量而不管脂肪酸链的长度和重量。如果游离脂肪酸的平均链长有所改变，单位重量甘油三酸酯的分子数也会改变，此时如果不对仪器重新定标，结果就会出现偏差。乳脂的成分和结构随季节，地区，乳牛品种和哺乳期的不同而变化。因此用Fat A测定的仪器在季节等变化时需要重新进行定标才能保证准确度。
FatB
FatB在3.5um(波数739)处有吸收是由于脂肪酸链C－H键的伸缩振动。因此脂肪分子的数量和大小的改变都不会影响测定准确度。
C－H键的数量与分子大小成正比。－CH3和－CH2都在3.5um处有吸收，但是C－H键的伸缩振动由于临近双键的存在而显着减少，因为不饱和性（－C＝C的数量）使吸收减少。然而，FatB测定对牛奶折射率的变化没有FatA测定敏感，因为前者反应的只是链长的变化。
FatB测定的另一个优点是测定结果包括游离脂肪酸，因此如果样品由于储存和处理产生的游离脂肪酸，FatA测定是不能做到的。
在早期的光谱方法机型中,有FatA和FatB的区别,但目前所有的中红外光谱分析仪器,在测定脂肪指标时,已经综合考虑了FatA和FatB的影响,大家不用太多关注.
