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藏医药经典《四部医典》、《晶珠本草》等记载黑枸杞主治心热病、心脏病、月经不调、停经等。《维吾尔药志》记载维吾尔医常用黑枸杞果实及根皮治疗尿道结石、癣疥、齿龈出血等症，民间用作滋补强壮以及降压药。

野生黑枸杞具有较高的医疗保健功能，其营养成分和药用价值要远远高于普通枸杞。

黑枸杞可以降血压、降低血脂和胆固醇，兴奋大脑神经，增强免疫功能，预防治疗心血管疾病和动脉硬化。并有抗肿瘤、抗病毒、抗辐射、抗凝血及抗氧化、延缓衰老等功效，也是女性美容养颜的滋补圣品。