中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室 课题组长
赵瑞琳，博士、中国科学院微生物研究所研究员，中国科学院大学岗位教授，博士生导师，国家重点研发计划项目首席科学家。2008年在泰国拉卡邦先皇技术学院获博士学位，并分别在比利时国家植物园、美国旧金山州立大学、加拿大多伦多大学、法国农科院、香港大学访学并开展科研工作。自2015年从西南林业大学通过人才引进进入中国科学院微生物研究所工作。长期从事食用菌资源的系统学及生物学研究。对我国伞菌资源进行系统的资源调查，现已发表伞菌新种属等120余个，包括具有潜在食用菌开发价值的新种新纪录种近20个，且部分已实现人工驯化，申请食用菌专利菌株。运用多基因序列及全基因组序列重建了担子菌门（覆盖食用菌90％以上物种）及其他重要类群的分类系统，为利用分子数据揭示新的食用菌资源奠定基础。主持及参加国家级项目7项，发表论文60多篇， 其中SCI论文50余篇，包括发表于本领域顶级期刊 《Fungal Diversity》、《Persoonia》、《Mycologia》等若干。
报告题目
担子菌门系统发育、演化时间及蛋白质组进化研究
摘 要
食用菌绝大多数种类属于担子菌门Basidiomycota，对其进行系统发育研究是资源开发利用的基础。为阐明高级分类单位间的系统发育关系，本研究共选择代表了担子菌门几乎所有的纲和目、及代表性科属529个物种作为研究材料，对它们的nrLSU、nrSSU、5.8S、tef1-α、rpb1和rpb2基因进行测序构建系统发育树。并利用化石标本作为演化时间校订点，采用分子钟方法建立担子菌门骨干类群的演化时间。最后选择109 个种的396 个直系同源基因的蛋白质组开展蛋白质组进化研究。研究中对于高级分类单位的认定遵从Zhao et al.（Fungal Divers 78:239–292, 2016）的标准：（1）该阶元所对应类群是演化时间分析统计中获得较高支持率的单系群，（2）同一等级阶元各类群对应的分化时间基本一致，（3）高级分类阶元的演化时间早于低级分类阶元。基于演化时间系统发育树显示担子菌门和根肿黑粉菌门的演化时间约为5.3亿年前，担子菌门下的亚门演化时间约为4.9亿年至4.06 亿年前，伞菌亚门Agaricomycotina下的多数纲的演化时间为3.58亿年至3.93亿年前，而锈菌亚门Pucciniomycotina和黑粉菌亚门Ustilaginomycotina的演化时间在2.45亿年至3.56亿年前，这些亚门下的目多分化于1.2至2.9亿年前。研究还表明白冬孢酵母目Leucosporidiales（微球黑粉菌纲Microbotryomycetes）分化时间较短，据此将这一类群并入微球黑粉菌目Microbotryales。同时，由巴克利菌科Buckleyzymaceae和坂口菌科Sakaguchiaceae由于具有较古老的演化时间，分别提升为巴克利菌目Buckleyzymales和坂口菌目Sakaguchiales。总体上来说，基于6 个基因的核酸序列和蛋白质组的系统树具有一致性，差异存在于节担子菌亚门、淀粉伏革菌目、木耳目、鸡油菌目、地星目、蜡壳耳目以及伞菌纲的糙孢孔目的具体系统发育位置上。本研究对这些核酸序列和蛋白质组的系统树间的差异进行了探讨。为基因直系同源性评价以及通过演化时间解析分类阶元提供了新观点和研究角度。
